Der Flughafen Neapel verfügt über ein einziges Terminal mit Check-in an der Landseite und Ankünften im Erdgeschoss. Auf der oberen Ebene befindet sich der Hauptabflugbereich A mit Geschäften, während die luftseitigen Bereiche B und C für nationale und internationale Flüge genutzt werden. Die Bushaltestelle von Alibus befindet sich in der Viale F. Ruffo di Calabria, in der Nähe des Eingangs zum Parkplatz P3.